ในปีการศึกษา 2562 นี้ โรงเรียนอนุบาลวัดอ่างทอง ได้มีการเพิ่ม ห้องเรียนพิเศษขึ้น จำนวน 2 ห้องในระดับชั้นปฐมวัย

1. หลักสูตรห้องเรียนพิเศษ Pre-Gifted (อนุบาล 3)

2. หลักสูตรห้องเรียนพิเศษ EP Junior (อนุบาล 3 ชวบ)
ภายใต้การบริหารงานของโครงการ Gifted Program และ โครงการ English Program ซึ่งมีการจัดการเรียนการสอนที่มุ่งเน้นให้ผู้เรียนพัฒนาทักษะทางด้านวิทยาศาสตร์ คณิตศาสตร์ และภาษาอังกฤษ อีกทั้งยังเป็นการเตรียมความพร้อม ในการเข้าศึกษาต่อในโครงการGifted Program และ โครงการ English Program ของโรงเรียนอนุบาลวัดอ่างทอง

หลักสูตรห้องเรียนพิเศษด้านภาษาอังกฤษ (EP)

หลักสูตรห้องเรียนพิเศษด้านภาษาอังกฤษ
English Program (EP)
เน้นการเรียนการสอนเป็นภาษาอังกฤษ ใน 4 รายวิชา ได้แก่ ภาษาอังกฤษ คณิตศาสตร์ วิทยาศาสตร์ และสุขศึกษา

หลักสูตรห้องเรียนพิเศษด้านคณิตศาสตร์และวิทยาศาสตร์(Gifted Program)

หลักสูตรห้องเรียนพิเศษด้านคณิตศาสตร์และวิทยาศาสตร์ (Gifted Program) 
เน้นการเรียนการสอนเพิ่มเติมในรายวิชาคณิตศาสตร์และวิทยาศาสตร์